Instytut

Dr hab. Adam Flakus

Profesor IB PAN

Jednostka
Grupa Bioróżnorodności i Ewolucji
E‑mail
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
Telefon
+4812‑4241‑711
Adres
Lubicz 46, 31‑512 Kraków
Pokój
B‑508

ORCIDRGGoogle Scholar

Zainteresowania badawcze

  • Ewolucja tropikalnych systemów symbiotycznych z udziałem grzybów, glonów i/lub cyanobakterii.
  • Taksonomia i filogeneza molekularna grzybów lichenizujących i naporostowych.
  • Zróżnicowanie mikrobiomu związanego z porostami i jego rola w symbiozach porostowych.
  • Ewolucja adaptacji między gospodarzem a pasożytem.
  • Interakcje między symbiontami wzdłuż gradientu środowiskowego.
  • Ewolucyjne konsekwencje symbiozy w zmieniającym się środowisku.
  • Katalog różnorodności biologicznej grzybów lichenizujących i naporostowych Boliwii.

Powiązane strony internetowe

Najnowsze publikacje (wybrane)

Adamski M., Flakus A., Kaminski A., Piątek J., Solarska M., Żmudzki P. 2024. The first report of the production of anatoxin-a by Bolivian terrestrial cyanobacteria. Acta Societatis Botanicorum Poloniae 93: 177923. DOI

Crous P.W., Jurjević Ž., Balashov S., De la Peña-Lastra S., Mateos A., Pinruan U., Rigueiro-Rodríguez A., Osiek E.R., Altés A., Czachura P., Esteve-Raventós F., Gunaseelan S., Kaliyaperumal M., Larsson E., Luangsa-ard J.J., Moreno G., Pancorbo F., Piątek M., Sommai S., Somrithipol S., Asif M., Delgado G., Flakus A., Illescas A., Kezo K., Khamsuntorn P., Kubátová A., Labuda R., Lavoise C., Lebel T., Lueangjaroenkit P., Maciá-Vicente J.G., Paz A., Saba M., Shivas R.G., Tan Y.P., Wingfield M.J., Aas T., Abramczyk B., Ainsworth A.M., Akulov A., Alvarado P., Armada F., Assyov B., Avchar R., Avesani M., Bezerra J.L., Bhat J.D., Bilański P., Bily D.S., Boccardo F., Bozok F., Campos J.C., Chaimongkol S., Chellappan N., Costa M.M., Dalecká M., Darmostuk V., Daskalopoulos V., Dearnaley J., Dentinger B.T.M., De Silva N.I., Dhotre D., Carlavilla J.R., Doungsa-ard C., Dovana F., Erhard A., Ferro L.O., Gallegos S.C., Giles C.E., Gore G., Gorfer M., Guard F.E., Hanson S.-Å., Haridev P., Jankowiak R., Jeffers S.N., Kandemir H., Karich A., Kisło K., Kiss L., Krisai-Greilhuber I., Latha K.P.D., Lorenzini M., Lumyong S., Manimohan P., Manjón J.L., Maula F., Mazur E., Mesquita N.L.S., Młynek K., Mongkolsamrit S., Morán P., Murugadoss R., Nagarajan M., Nalumpang S., Noisripoom W., Nosalj S., Novaes Q.S., Nowak M., Pawłowska J., Peiger M., Pereira O.L., Pinto A., Plaza M., Polemis E., Polhorský A., Ramos D.O., Raza M., Rivas-Ferreiro M., Rodrigues-Flakus P., Ruszkiewicz-Michalska M., Sánchez A., Santos A., Schüller A., Scott P.A., Şen İ., Shelke D., Śliwa L., Solheim H., Sonawane H., Strašiftáková D., Stryjak-Bogacka M., Sudsanguan M., Suwannarach N., Suz L.M., Syme K., Taşkın H., Tennakoon D.S., Tomka P., Vaghefi N., Vasan V., Vauras J., Wiktorowicz D., Villarreal M., Vizzini A., Wrzosek M., Yang X., Yingkunchao W., Zapparoli G., Zervakis G.I., Groenewald J.Z. 2024. Fungal Planet description sheets: 1614–1696. Fungal Systematics and Evolution 13: 183–440. DOI

Darmostuk V., Flakus A. 2024. First molecular evidence of lichen-inhabiting Acrospermum and new insights into the evolution of lifestyles of Acrospermales (Dothideomycetes). Mycologia 116: 17–30. DOI

Ossowska E.A., Moncada B., Lücking R., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Olszewska S., Kukwa M. 2024. Additional new species and new records of the genus Sticta (lichenised Ascomycota, lobarioid Peltigeraceae) from Bolivia. MycoKeys 105: 21–47. DOI

Crous P.W., Osieck E.R., Shivas R.G., Tan Y.P., Bishop-Hurley S.L., Esteve-Raventós F., Larsson E., Luangsa-ard J.J., Pancorbo F., Balashov S., Baseia I.G., Boekhout T., Chandranayaka S., Cowan D.A., Cruz R.H.S.F., Czachura P., De la Peña-Lastra S., Dovana F., Drury B., Fell J., Flakus A., Fotedar R., Jurjević Ž., Kolecka A., Mack J., Maggs-Kölling G., Mahadevakumar S., Mateos A., Mongkolsamrit S., Noisripoom W., Plaza M., Overy D.P., Piątek M., Sandoval-Denis M., Vauras J., Wingfield M.J., Abell S.E., Ahmadpour A., Akulov A., Alavi F., Alavi Z., Altes A., Alvarado P., Anand G., Ashtekar N., Assyov B., Banc-Prandi G., Barbosa K.D., Barreto G.G., Bellanger J.-M., Bezerra J.L., Bhat D.J., Bilanski P., Bose T., Bozok F., Chaves J., Costa-Rezende D.H., Danteswari C., Darmostuk V., Delgado G., Denman S., Eichmeier A., Etayo J., Eyssartier G., Faulwetter S., Ganga K.G.G., Ghosta Y., Goh J., Góis J.S., Gramaje D., Granit L., Groenewald M., Gulden G., Gusmão L.F.P., Hammerbacher A., Heidarian Z., Hywel-Jones N., Jankowiak R., Kaliyaperumal M., Kaygusuz O., Kezo K., Khonsanit A., Kumar S., Kuo C.H., Læssøe T., Latha K.P.D., Loizides M., Luo S.M., Maciá-Vicente J.G., Manimohan P., Marbach P.A.S., Marinho P., Marney T.S., Marques G., Martín M.P., Miller A.N., Mondello F., Moreno G., Mufeeda K.T., Mun H.Y., Nau T., Nkomo T., Okrasińska A., Oliveira J.P.A.F., Oliveira R.L., Ortiz D.A., Pawłowska J., Pérez-De-Gregorio M.À., Podile A.R., Portugal A., Privitera N., Rajeshkumar K.C., Rauf I., Rian B., Rigueiro-Rodríguez A., Rivas-Torres G.F., Rodriguez-Flakus P., Romero-Gordillo M., Saar I., Saba M., Santos C.D., Sarma P.V.S.R.N., Siquier J.L., Sleiman S., Spetik M., Sridhar K.R., Stryjak-Bogacka M., Szczepańska K., Taşkın H., Tennakoon D.S., Thanakitpipattana D., Trovao J., Türkekul İ., van Iperen A.L., van ’t Hof P., Vasquez G., Visagie C.M., Wingfield B.D., Wong P.T.W., Yang W.X., Yarar M., Yarden O., Yilmaz N., Zhang N., Zhu Y.N., Groenewald J.Z. 2023. Fungal Planet description sheets: 1478–1549. Persoonia 50: 158–310. DOI

Kukwa M., Kosecka M., Jabłońska A., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Guzow-Krzemińska B. 2023. Pseudolepraria, a new leprose genus revealed in Ramalinaceae (Ascomycota, Lecanoromycetes, Lecanorales) to accommodate Lepraria stephaniana. MycoKeys 96: 97–112. DOI

Kukwa M., Rodriguez-Flakus P., Aptroot A., Flakus A. 2023. Two new species of Astrothelium from Sud Yungas in Bolivia and the first discovery of vegetative propagules in the family Trypetheliaceae (lichen-forming Dothideomycetes, Ascomycota). MycoKeys 95: 83–100. DOI

Diederich P., Millanes A.M., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Etayo J., Wedin M. 2022. Class Cystobasidiomycetes, order Cyphobasidiales. In: P. Diederich., A.M. Millanes, M. Wedin, J.D. Lawrey (eds.). Flora of Lichenicolous Fungi, Vol. 1, Basidiomycota. National Museum of Natural History, Luxembourg: 305–324.

Diederich P., Millanes A.M., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Etayo J., Wedin M. 2022. Class Tremellomycetes, order Filobasidiales. In: P. Diederich., A.M. Millanes, M. Wedin, J.D. Lawrey (eds.). Flora of Lichenicolous Fungi, Vol. 1, Basidiomycota. National Museum of Natural History, Luxembourg: 83–104.

Kosecka M., Kukwa M., Jabłońska A., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Ptach Ł., Guzow-Krzemińska B. 2022. Phylogeny and ecology of Trebouxia photobionts from Bolivian lichens. Frontiers in Microbiology 13: 779784. DOI

Ossowska E.A., Moncada B., Kukwa M., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Olszewska S., Lücking R. 2022. New species of Sticta (lichenised Ascomycota, lobarioid Peltigeraceae) from Bolivia suggest a high level of endemism in the Central Andes. MycoKeys 92: 131–160. DOI

Wijayawardene N.N., Phillips A.J.L., Santos Pereira D., Dai D.-Q., Aptroot A., Monteiro J.S., Druzhinina I.S., Cai F., Fan X., Selbmann L., Coleine C., Castañeda‑Ruiz R.F., Kukwa M., Flakus A., Fiuza P.O., Kirk P.M., Kumar K.C.R., Ileperuma Arachchi I.S., Suwannarach N., Tang L.-Z., Boekhout T., Tan C.S., Jayasinghe R.P.P.K., Thines M. 2022. Forecasting the number of species of asexually reproducing fungi (Ascomycota and Basidiomycota). Fungal Diversity 114: 463–490. DOI

Medeiros I.D., Mazur E., Miadlikowska J., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Pardo-De la Hoz C.J., Cieślak E., Śliwa L., Lutzoni F. 2021. Turnover of lecanoroid mycobionts and their Trebouxia photobionts along an elevation gradient in Bolivia highlights the role of environment in structuring the lichen symbiosis. Frontiers in Microbiology 12: 774839. DOI

Kosecka M., Jabłońska A., Flakus A., Rodriguez‐Flakus P., Kukwa M., Guzow‐Krzemińska B. 2020. Trentepohlialean algae (Trentepohliales, Ulvophyceae) show preference to selected mycobiont lineages in lichen symbioses. Journal of Phycology 56: 979–993. DOI

Miranda-González R., Aptroot A., Lücking R., Flakus A., Barcenas-Peña A., de los Ángeles Herrera-Campos M. 2020. The identity, ecology and distribution of Polypyrenula (Ascomycota: Dothideomycetes): a new member of Trypetheliaceae revealed by molecular and anatomical data. The Lichenologist 52: 27–35. DOI

Piątek M., Rodriguez-Flakus P., Domic A., Palabral-Aquilera A.N., Gómez M.I., Flakus A. 2020. Phylogenetic placement of Leptosphaeria polylepidis, a pathogen of Andean endemic Polylepis tarapacana, and its newly discovered mycoparasite Sajamaea mycophila gen. et sp. nov. Mycological Progress 19: 1–14. DOI

Wijayawardene N.N., Hyde K.D., Al-Ani L.K.T., Tedersoo L., Haelewaters D., Rajeshkumar K.C., Zhao R.L., Aptroot A., Leontyev D.V., Saxena R.K., Tokarev Y.S., Dai D.Q., Letcher P.M., Stephenson S.L., Ertz D., Lumbsch H.T., Kukwa M., Issi I.V., Madrid H., Phillips A.J.L., Selbmann L., Pfliegler W.P., Horváth E., Bensch K., Kirk P.M., Kolaříková K., Raja H.A., Radek R., Papp V., Dima B., Ma J., Malosso E., Takamatsu S., Rambold G., Gannibal P.B., Triebel D., Gautam A.K., Avasthi S., Suetrong S., Timdal E., Fryar S.C., Delgado G., Réblová M., Doilom M., Dolatabadi S., Pawłowska J.Z., Humber R.A., Kodsueb R., Sánchez-Castro I., Goto B.T., Silva D.K.A., de Souza F.A., Oehl F., da Silva G.A., Silva I.R., Błaszkowski J., Jobim K., Maia L.C., Barbosa F.R., Fiuza P.O., Divakar P.K., Shenoy B.D., Castañeda-Ruiz R.F., Somrithipol S., Lateef A.A., Karunarathna S.C., Tibpromma S., Mortimer P.E., Wanasinghe D.N., Phookamsak R., Xu J., Wang Y., Tian F., Alvarado P., Li D.W., Kušan I., Matočec N., Mešić A., Tkalčec Z., Maharachchikumbura S.S.N., Papizadeh M., Heredia G., Wartchow F., Bakhshi M., Boehm E., Youssef N., Hustad V.P., Lawrey J.D., Santiago A.L.C.M.A., Bezerra J.D.P., Souza-Motta C.M., Firmino A.L., Tian Q., Houbraken J., Hongsanan S., Tanaka K., Dissanayake A.J., Monteiro J.S., Grossart H.P., Suija A., Weerakoon G., Etayo J., Tsurykau A., Vázquez V., Mungai P., Damm U., Li Q.R., Zhang H., Boonmee S., Lu Y.Z., Becerra A.G., Kendrick B., Brearley F.Q., Motiejūnaitė J., Sharma B., Khare R., Gaikwad S., Wijesundara D.S.A., Tang L.Z., He M.Q., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Zhurbenko M.P., McKenzie E.H.C., Stadler M., Bhat D.J., Liu J.K., Raza M., Jeewon R., Nassonova E.S., Prieto M., Jayalal R.G.U., Erdoğdu M., Yurkov A., Schnittler M., Shchepin O.N., Novozhilov Y.K., Silva-Filho A.G.S., Gentekaki E., Liu P., Cavender J.C., Kang Y., Mohammad S., Zhang L.F., Xu R.F., Li Y.M., Dayarathne M.C., Ekanayaka A.H., Wen T.C., Deng C.Y., Pereira O.L., Navathe S., Hawksworth D.L., Fan X.L., Dissanayake L.S., Kuhnert E., Grossart H.P., Thines M. 2020. Outline of Fungi and fungus-like taxa. Mycosphere 11: 1060–1456. DOI

Flakus A., Etayo J., Miadlikowska J., Lutzoni F., Kukwa M., Matura N., Rodriguez-Flakus P. 2019. Biodiversity assessment of ascomycetes inhabiting Lobariella lichens in Andean cloud forests led to one new family, three new genera and 13 new species of lichenicolous fungi. Plant and Fungal Systematics 64: 283–344. DOI

Flakus A., Etayo J., Pérez-Ortega S., Kukwa M., Palice Z., Rodriguez-Flakus P. 2019. A new genus, Zhurbenkoa, and a novel nutritional mode revealed in the family Malmideaceae (Lecanoromycetes, Ascomycota). Mycologia 111: 593–611. DOI

Guzow-Krzemińska B., Flakus A., Kosecka M., Jabłońska A., Rodriguez-Flakus P., Kukwa M. 2019. New species and records of lichens from Bolivia. Phytotaxa 397: 257–279. DOI

Guzow-Krzemińska B., Jabłońska A., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Kosecka M., Kukwa M. 2019. Phylogenetic placement of Lepraria cryptovouauxii sp. nov. (Lecanorales, Lecanoromycetes, Ascomycota) with notes on other Lepraria species from South America. MycoKeys 53: 1–22. DOI

Etayo J., Flakus A., Kukwa M. 2018. Three new lichenicolous species of the genus Plectocarpon (Ascomycota: Lecanographaceae) discovered in the Bolivian Andes. Phytotaxa 357: 275–283. DOI

Zamora J.C., Svensson M., Kirschner R., Olariaga I., Ryman S., Parra L.A., Geml J., Rosling A., Adamčík S., Ahti T., Aime M.C., Ainsworth A.M., Albert L., Albertó E., Altés García A., Ageev D., Agerer R., Aguirre-Hudson B., Ammirati J., Andersson H., Angelini C., Antonín V., Aoki T., Aptroot A., Argaud D., Arguello Sosa B.I., Aronsen A., Arup U., Asgari B., Assyov B., Atienza V., Bandini D., Baptista-Ferreira J.L., Baral H.O., Baroni T., Barreto R.W., Beker H., Bell A., Bellanger J.M., Bellù F., Bemmann M., Bendiksby M., Bendiksen E., Bendiksen K., Benedek L., Bérešová-Guttová A., Berger F., Berndt R., Bernicchia A., Biketova A.Y., Bizio E., Bjork C., Boekhout T., Boertmann D., Böhning T., Boittin F., Boluda C.G., Boomsluiter M.W., Borovička J., Brandrud T.E., Braun U., Brodo I., Bulyonkova T., Burdsall Jr. H.H., Buyck B., Burgaz A.R., Calatayud V., Callac P., Campo E., Candusso M., Capoen B., Carbó J., Carbone M., Castañeda-Ruiz R.F., Castellano M.A., Chen J., Clerc P., Consiglio G., Corriol G., Courtecuisse R., Crespo A., Cripps C., Crous P.W., da Silva G.A., da Silva M., Dam M., Dam N., Dämmrich F., Das K., Davies L., De Crop E., De Kesel A., De Lange R., De Madrignac Bonzi B., dela Cruz T.E.E., Delgat L., Demoulin V., Desjardin D.E., Diederich P., Dima B., Dios M.M., Divakar P.K., Douanla-Meli C., Douglas B., Drechsler-Santos E.R., Dyer P.S., Eberhardt U., Ertz D., Esteve-Raventós F., Etayo Salazar J.A., Evenson V., Eyssartier G., Farkas E., Favre A., Fedosova A.G., Filippa M., Finy P., Flakus A., Fos S., Fournier J., Fraiture A., Franchi P., Franco Molano A.E., Friebes G., Frisch A., Fryday A., Furci G., Galán Márquez R., Garbelotto M., García-Martín J.M., García Otálora M.A., García Sánchez D., Gardiennet A., Garnica S., Garrido Benavent I., Gates G., Gerlach A.C.L., Ghobad-Nejhad M., Gibertoni T.B., Grebenc T., Greilhuber I., Grishkan B., Groenewald J.Z., Grube M., Gruhn G., Gueidan C., Gulden G., Gusmão L.F.P., Hafellner J., Hairaud M., Halama M., Hallenberg N., Halling R.E., Hansen K., Harder C.B., Heilmann-Clausen J., Helleman S., Henriot A., Hernandez-Restrepo M., Herve R., Hobart C., Hoffmeister M., Høiland K., Holec J., Holien H., Hughes K., Hubka V., Huhtinen S., Ivančevi B., Jagers M., Jaklitsch W., Jansen A.E., Jayawardena R.S., Jeppesen T.S., Jeppson M., Johnston P., Jørgensen P.M., Kärnefelt I., Kalinina L.B., Kantvilas G., Karadelev M., Kasuya T., Kautmanová I., Kerrigan R.W., Kirchmair M., Kiyashko A., Knapp D.G., Knudsen H., Knudsen K., Knutsson T., Kolařík M., Kõljalg U., Košuthová A., Koszka A., Kotiranta H., Kotkova V., Koukol O., Kout J., Kovács G.M., Kříž M., Kruys Å., Kučera V., Kudzma L., Kuhar F., Kukwa M., Kumar T.K.A., Kunca V., Kušan I., Kuyper T.W., Lado C., Læssøe T., Lainé P., Langer E., Larsson E., Larsson K.H., Laursen G., Lechat C., Lee S., Lendemer J.C., Levin L., Lindemann U., Lindström H., Liu X., Llarena Hernandez R.C., Llop E., Locsmándi C., Lodge D.J., Loizides M., Lőkös L., Luangsa-ard J., Lüderitz M., Lumbsch T., Lutz M., Mahoney D., Malysheva E., Malysheva V., Manimohan P., Marin-Felix Y., Marques G., Martínez-Gil R., Marson G., Mata G., Matheny P.B., Mathiassen G.H., Matočec N., Mayrhofer H., Mehrabi M., Melo I., Meši A., Methven A.S., Miettinen O., Millanes Romero A.M., Miller A.N., Mitchell J.K., Moberg R., Moreau P.A., Moreno G., Morozova O., Morte A., Muggia L., Muñoz González G., Myllys L., Nagy I., Nagy L.G., Neves M.A., Niemelä T., Nimis P.L., Niveiro N., Noordeloos M.E., Nordin A., Noumeur S.R., Novozhilov Y., Nuytinck J., Ohenoja E., Oliveira Fiuza P., Orange A., Ordynets A., Ortiz-Santana B., Pacheco L., Pál-Fám F., Palacio M., Palice Z., Papp V., Pärtel K., Pawlowska J., Paz A., Peintner U., Pennycook S., Pereira O.L., Pérez Daniëls P., Pérez-De-Gregorio Capella M.À., Pérez del Amo C.M., Pérez Gorjón S., Pérez-Ortega S., Pérez-Vargas I., Perry B.A., Petersen J.H., Petersen R.H., Pfister D.H., Phukhamsakda C., Piątek M., Piepenbring M., Pino-Bodas R., Pinzón Esquivel J.P., Pirot P., Popov E.S., Popoff O., Prieto Álvaro M., Printzen C., Psurtseva N., Purahong W., Quijada L., Rambold G., Ramírez N.A., Raja H., Raspé O., Raymundo T., Réblová M., Rebriev Y.A., Reyes García J.D., Ribes Ripoll M.A., Richard F., Richardson M.J., Rico V.J., Robledo G.L., Rodrigues Barbosa F., Rodriguez-Caycedo C., Rodriguez-Flakus P., Ronikier A., Rubio Casas L., Rusevska K., Saar G., Saar I., Salcedo I., Salcedo Martínez S.M., Salvador Montoya C.A., Sánchez Ramírez S., Sandoval-Sierra J.V., Santamaria S., Santana Monteiro J., Schroers H.J., Schulz B., Schmidt-Stohn G., Schumacher T., Senn-Irlet B., Ševčíková H., Shchepin O., Shirouzu T., Shiryaev A., Siepe K., Sir E.B., Sohrabi M., Soop K., Spirin V., Spribille T., Stadler M., Stalpers J., Stenroos S., Suija A., Sunhede S., Svantesson S., Svensson S., Svetasheva T.Yu., Świerkosz K., Tamm H., Taskin H., Taudière A., Tedebrand J.-O., Tena Lahoz R., Temina M., Thell A., Thines M., Thor G., Thüs H., Tibell L., Tibell S., Timdal E., Tkalčec Z., Tønsberg T., Trichies G., Triebel D., Tsurykau A., Tulloss R.E., Tuovinen V., Ulloa Sosa M., Urcelay C., Valade F., Valenzuela Garza R., van den Boom P., Van Vooren N., Vasco-Palacios A.M., Vauras J., Velasco Santos J.M., Vellinga E., Verbeken A., Vetlesen P., Vizzini A., Voglmayr H., Volobuev S., von Brackel W., Voronina E., Walther G., Watling R., Weber E., Wedin M., Weholt Ø., Westberg M., Yurchenko E., Zehnálek P., Zhang H., Zhurbenko M.P., Ekman S. 2018. Considerations and consequences of allowing DNA sequence data as types of fungal taxa. IMA Fungus 9: 167–175. DOI

Rodriguez-Flakus P., Flakus A. 2017. Líquenes y hongos liquenícolas del valle de La Paz. In: M.I. Moya, R.I. Meneses, J. Sarmiento (eds.). Historia natural del valle de La Paz. Tercera Edición. Museo Nacional de Historia Natural, La Paz: 125–132.

Wei X., Schmitt I., Hodkinson B., Flakus A., Kukwa M., Divakar P.K., Kirika P.M., Otte J., Meiser A., Lumbsch H.T. 2017. Circumscription of the genus Lepra, a recently resurrected genus to accommodate the "Variolaria"-group of Pertusaria sensu lato (Pertusariales, Ascomycota). PLoS ONE 12: e0180284. DOI

Wilk K., Flakus A. 2017. Eight Caloplaca species newly recorded from Bolivia, including C. crocina comb. nov. Mycotaxon 132: 125–140. DOI

Ahti T., Pino-Bodas R., Flakus A., Stenroos S. 2016. Additions to the global diversity of Cladonia. The Lichenologist 48: 517–526. DOI

Farkas E., Flakus A. 2016. Trichonectria calopadiicola sp. nov. (Hypocreales, Ascomycota): the second species of the family Bionectriaceae parasitic on foliicolous lichens discovered in Tanzania. Phytotaxa 278: 281–286. DOI

Flakus A., Kukwa M., Aptroot A. 2016. Trypetheliaceae of Bolivia: an updated checklist with descriptions of twenty-four new species. Lichenologist 48: 661–692. DOI

Kanigowski P., Flakus A., Oset M., Kowalewska A., Rykaczewki M., Kukwa M. 2016. The lichen family Parmeliaceae in Poland. Xanthoparmelia species containing usnic acid. Herzogia 29: 108–119. DOI

Knudsen K., Flakus A. 2016. The identity of Acarospora xanthophana (Fungi: Ascomycota) and a description of A. congregata sp. nov. to accommodate a widely distributed saxicolous species occurring in the higher elevations of South America. Taxon 65: 146–151. DOI